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Re:Wims et jmol (1 lecteur(s)) (1) Invité(s)
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SUJET: Re:Wims et jmol
#813
c.cauwet (Utilisateur)
Junior Boarder
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graphgraph
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Wims et jmol Il y a 15 Années, 1 Mois Karma: 0  
Bonjour,

Est ce que wims permet d'utiliser Jmol, outil de visualisation de molécules en Java.

Si oui, quelqu'un aurait-il un exemple de mise en oeuvre ?

D'avance merci

Christophe
 
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#814
byache (Utilisateur)
Expert Boarder
Messages: 121
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Sexe: Masculin MathFle Lieu: Marseille
Re:Wims et jmol Il y a 15 Années, 1 Mois Karma: 0  
Je ne crois pas qu'il y ait quelque chose de prévu pour Jmol, mais il existe une slib pour le visualisateur de molécule "LatticeViewer"...
Pour voir la documentation, aller dans la doc technique en anglais (lien "techdoc" en bas de la page d'accueil du serveur wims), puis "List of slib (library of scripts)" et enfin, chercher la slib "chemistry/moleculeViewer".
Paul.
 
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#817
Yves NOEL (Utilisateur)
Fresh Boarder
Messages: 19
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Re:Wims et jmol Il y a 15 Années, 1 Mois Karma: 0  
bonjour,
OUI
c est possible d intégrer une structure jmol dans un module wims

Il suffit de déposer (comme fichiers binaires) les 2 fichiers jmol.js et jmolApplet.jar dans le répertoire image (ou image/nom_module, je ne sais plus)

Ensuite la référence à ce répertoire est \imagedir

Apres on insère tout ce que l on met habituellement dans une page html contenant une applet jmol dans le statement de wims.

voici un exemple

Code :

\statement{ <script type="text/javascript" src="\imagedir/Jmol.js"></script> <SCRIPT type="text/javascript"> jmolInitialize("\imagedir/","JmolApplet.jar"); jmolApplet(400,'load \imagedir/polyvert.xyz;'); </SCRIPT> blabla <SCRIPT type="text/javascript"> jmolScriptWait("select all; color atom red;",0); </SCRIPT> }
En espèrant que ca aide. Yves
 
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#818
bernadette (Admin)
Administrateur
Messages: 638
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Re:Wims et jmol Il y a 15 Années, 1 Mois Karma: 23  
Un complément :

Il vaudra mieux si possible ensuite ne pas multiplier les JmolApplet.jar dans les modules individuels (question de poids en particulier). Il y a actuellement des fichiers Jmol.js et
JmolApplet.jar dans la distribution. Je les mettrai à jour pour la prochaine version stable de wims.

Dans ce cas, il faut remplacer dans ce que dit Yves
\imagedir/ par java/jmol/ (pas testé, car je n'ai pas le fichier polyvert.xyz qui lui doit rester dans \imagedir, je suppose).

Ce que ne dit pas Yves, c'est qu'il a des grands projets d'utilisation !

Au fur et à mesure de l'utilisation, il faudra voir si un type de réponse "simple" se dégage. Quelle type de question veux-tu poser, Christophe ?
Bernadette
 
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#854
c.cauwet (Utilisateur)
Junior Boarder
Messages: 31
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Re:Wims et jmol Il y a 15 Années Karma: 0  
Bonjour

Je confirme que le mix des deux solutions proposées fonctionne. J'avais effectivement vu en cherchant que jmol faisait partie des paquets inclus dans wims. Merci de m'avoir donné la clé de son utilisation.

Christophe

Exemple dans statement :

Code :

<script type="text/javascript" src="java/jmol/Jmol.js"></script> <SCRIPT type="text/javascript"> jmolInitialize("java/jmol","JmolApplet.jar"); jmolApplet(200,'load \imagedir/\image;'); </SCRIPT> <script> var script=\imagedir/\image; jmolApplet(200, script); </script>
 
 
Dernière édition: 05-06-2009 à 07:33 Par c.cauwet.
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